投资者普遍认为，令伊利股份跌停根源在于亏损，而造成其亏损的原因正是当初受到市场资金热捧时的题材--股权激励，因实施股权激励计划导致原来可实现赢利的公司出现亏损，难怪不少机构投资者都说，在对伊利的投资上"整年实际上都没有赚到钱"，这实在是给投资者开了一个天大的玩笑。
伊利之所以会出现这种现象，从企业原因上说，就在于伊利股份在设计股权激励计划时犯了两个错误，一是将门槛定得太低，二是同时股权激励的成本没有经过严格审议，份额过高。而实则深究下去，重要监管要点和制度的缺失，则是根本原因。其中，无论是企业，还是监管部门，对股权激励成本对业绩的影响重视不足，导致这样一个"本质上就一定会造成亏损"的激励计划出台并通过。
伊利股份股权激励的行权条件主要为：首期行权时，伊利股份上一年度扣除非经常性损益后的净利润增长率不低于17%，且上一年度主营业务收入增长率不低于20%；首期以后行权时，伊利股份上一年度主营业务收入与2005年相比的复合增长率不低于15%。
在当时监管部门没有对行权条件约束的情况下，伊利采用这样一个主要以主营业务收入为标的业绩条件作为主要门槛，而不是股东价值关注的利润和投资收益率。难怪有媒体称：伊利的股权激励，简直就如白送一般。尤其是首期以后的行权，根本没有考虑净利润增长的因素，如此一来，就算2007年伊利股份的利润出现亏损了，但只要主营业务收入与2005年相比的复合增长率达到了15%，该公司的股权激励同样还符合行权条件的要求。
与之相对比，2004年蒙牛上市前，与大摩等风险投资签署了一份"对赌"协议：蒙牛要在未来3年内年赢利复合增长率达到50%，否则蒙牛管理层就必须将所持7.8%的公司股权，即7830万股转让给大摩等外资股东。与在乳业市场上同样地位的蒙牛相比，伊利股份股权激励门槛与收获之不成比例由此可见。在新会计准则下，这种"便宜"要在财务上有相应的负向体现，不可能再用"市场买单"等被私下消化，这也正是出现伊利股份股权激励导致公司利润亏损的一个原因。
